Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA2D1P54289 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms