Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCAMP50895 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCAMP50895 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BCAMP50895 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCAMP50895 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BCAMP50895 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BCAMP50895 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BCAMP50895 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BCAMP50895 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BCAMP50895 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms