Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP2P32456 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP2P32456 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP2P32456 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GBP2P32456 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GBP2P32456 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms