Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SFNP31947 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SFNP31947 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SFNP31947 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms