Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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HOXA13P31271 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXA13P31271 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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