Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF2E1P29083 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms