Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MCM3P25205 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MCM3P25205 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCM3P25205 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCM3P25205 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCM3P25205 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCM3P25205 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCM3P25205 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCM3P25205 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCM3P25205 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MCM3P25205 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MCM3P25205 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCM3P25205 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MCM3P25205 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCM3P25205 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCM3P25205 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCM3P25205 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCM3P25205 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MCM3P25205 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MCM3P25205 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms