Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ERCC3P19447 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms