Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BRAFP15056 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BRAFP15056 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BRAFP15056 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BRAFP15056 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BRAFP15056 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BRAFP15056 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BRAFP15056 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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