Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI1P08151 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI1P08151 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI1P08151 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GLI1P08151 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GLI1P08151 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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