Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTMAP06454 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTMAP06454 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTMAP06454 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTMAP06454 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTMAP06454 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTMAP06454 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTMAP06454 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms