Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP35Q9P2H5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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