Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RSPO2-202ENST00000517781 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms