Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SGCZQ96LD1 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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