Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTXN3Q4LDR2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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