Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms