Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms