Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTCH1Q13635 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTCH1Q13635 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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