Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUL4BQ13620 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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