Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TUBB4BP68371 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms