Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MCCD1P59942 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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MCCD1P59942 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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MCCD1P59942 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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MCCD1P59942 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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MCCD1P59942 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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MCCD1P59942 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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MCCD1P59942 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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MCCD1P59942 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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MCCD1P59942 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
MCCD1P59942 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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