Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RIPPLY3P57055 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms