Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FOSBP53539 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FOSBP53539 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
FOSBP53539 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms