Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GGCXP38435 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms