Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLD1P28340 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLD1P28340 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLD1P28340 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms