Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms