Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ITGA4P13612 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms