Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
IFNB1P01574 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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