Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL3O43909 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms