Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
NICN1Q9BSH3 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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