Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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NUP35Q8NFH5 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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NUP35Q8NFH5 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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