Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DUSP18Q8NEJ0 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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