Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ATG16L1Q676U5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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ATG16L1Q676U5 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATG16L1Q676U5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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