Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AC010624.1-201ENST00000527209 1525 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LINC00342-202ENST00000448494 2351 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ERBB2-204ENST00000541774 4341 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CPSF3-202ENST00000460593 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TP63-209ENST00000437221 2500 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 RHD-201ENST00000328664 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ATP11AUN-201ENST00000623100 2241 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TWNK-202ENST00000370228 3175 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ESRP2-210ENST00000565858 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MUC4-203ENST00000346145 3982 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ELP2-202ENST00000351393 2453 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MRPS25-201ENST00000253686 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 FYCO1-201ENST00000296137 8504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 FCGR3A-206ENST00000443193 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 BOLA2-SMG1P6-201ENST00000565417 3103 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 KCNA10-201ENST00000369771 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ARHGAP27-202ENST00000376922 3628 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 MTERF2-207ENST00000552029 3235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ZNF559-213ENST00000603380 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 CALCOCO1-202ENST00000430117 2706 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 BRD4-203ENST00000371835 4624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
UBE2V1Q13404 ANKRD18CP-201ENST00000354752 2980 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms