Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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AP3B2Q13367 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP3B2Q13367 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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