Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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NPRL3Q12980 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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NPRL3Q12980 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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NPRL3Q12980 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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NPRL3Q12980 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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NPRL3Q12980 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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NPRL3Q12980 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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NPRL3Q12980 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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NPRL3Q12980 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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NPRL3Q12980 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NPRL3Q12980 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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