Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LMO4P61968 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LMO4P61968 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms