Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RANGAP1P46060 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms