Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMPOP42166 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMPOP42166 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMPOP42166 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms