Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ITGA3P26006 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ITGA3P26006 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms