Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ITGA4P13612 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms