Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMIM10L2BP0DMW5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms