Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRAMEF22A3QJZ6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRAMEF22A3QJZ6 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms