Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CHST11Q9NPF2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms