Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYNGAP1Q96PV0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms