Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms