Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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GTF3C6Q969F1 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GTF3C6Q969F1 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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