Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms