Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HECW1Q76N89 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HECW1Q76N89 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECW1Q76N89 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms