Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PRAMEF20Q5VT98 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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